1953年、籔内佐斗司は大阪府大阪市に生まれました。
大阪府の高校を卒業後に上京。東京藝術大学の美術学部彫刻科で学びます。 その後、大学院に進み、1980年に修了。以後は母校の非常勤講師を務めつつ、仏教彫刻の研究を行います。この間、奈良の「薬師寺地蔵菩薩立像」や、埼玉の「平林寺十六羅漢像」の保存・修復事業に携わりました。

そんな籔内佐斗司が、彫刻家として本格的に活動をスタートさせたのは1987年のことでした。 優れた才能を発揮して数々の作品を手がけ、1988年には早くもアメリカのニューヨークで個展「Satoshi Yabuuchi Exhibition」を開催しています。 1990年代に入ってからも、「籔内佐斗司の博物学的世界」「籔内佐斗司の世界・色心不二」といった展覧会で話題を呼び、2003年には平櫛田中賞を受賞。翌年には東京藝術大学の教授に就任します。 大学では文化財保存学の分野で教鞭をとり、2010年代に入ってからは福島県の磐梯町からの依頼を受けて「本尊丈六薬師如来坐像」の修復を手がけるなどして活躍。また2021年には奈良県立美術館の館長に就任。現在も多方面で活躍を続けています。